O estudante do ensino médio Watanuki Kimihiro tem a capacidade de ver espíritos e monstros, mas é realmente atormentado com eles. Voltando para casa um dia, ele é mais uma vez assaltado por aparições malignas, mas seus pés o levam a uma loja estranha. Lá ele encontra Ichihara Yuko, o misterioso dono que se oferece para conceder o desejo de Watanuki de se livrar dos espíritos. Mas o preço deve ser de igual valor, então Watanuki tem que trabalhar temporariamente para ela em sua loja que concede desejos. Assim começa suas aventuras em um mundo cheio de experiências sobrenaturais.
