O ex-lendário assassino Kenshin Himura tornou-se um samurai errante. Oferecer ajuda e proteger os necessitados como expiação por seus feitos passados. Durante esse tempo, aparece e auxilia Kaoru Kamiya. Seu pai abriu a Kamiya Kasshin-ryu, uma escola de kendo localizada em Tóquio e Kaoru agora é instrutor lá. Kaoru então convida Kenshin para ficar em seu dojo. O relacionamento deles se desenvolve ainda mais, mas Kenshin ainda é assombrado por seu passado violento.