A história centra-se em dois estudantes do ensino médio. Risa Koizumi é a garota mais alta da classe, e a última coisa que ela quer é a humilhação de ficar ao lado de Atsushi Otani, o cara mais baixo. Mas o destino e toda a escola têm outras idéias, e os dois se veem escalados como as estrelas relutantes de uma bizarra dupla de comédia romântica.
À medida que a amizade deles floresce, os sentimentos de Risa também se oprimem em relação a Otani. Lovely Complex examina os sentimentos e momentos cômicos muitas vezes complicados da experiência de namorar pessoas de diferentes alturas. Uma garota, por causa de sua baixa estatura, anteriormente rejeitou Otani e ele acha que ele parece peculiar com uma namorada mais alta. Risa tem o problema oposto, já alto e nunca encontrar um cara mais alto.
À medida que a amizade deles floresce, os sentimentos de Risa também se oprimem em relação a Otani. Lovely Complex examina os sentimentos e momentos cômicos muitas vezes complicados da experiência de namorar pessoas de diferentes alturas. Uma garota, por causa de sua baixa estatura, anteriormente rejeitou Otani e ele acha que ele parece peculiar com uma namorada mais alta. Risa tem o problema oposto, já alto e nunca encontrar um cara mais alto.
